二次调查数据显示，2009年全省耕地数目比1996年第一次调查时的耕地642.16万公顷（9632.84万亩）减少了了17.77万公顷（266.52万亩），比基于一次调查逐年变更到2008年的耕地607.21万公顷（9108.09万亩）多出17.18万公顷（257.75万亩），这主要是由于调查标准，技术方法的改进和农村税费政策调整等因素影响，使二次调查的数据更加全面、客观、准确。

从耕地质量看，全省耕地中有旱地473.90万公顷（7108.57万亩），占耕地比例高达75.90%，有90.76万公顷（1361.37万亩）耕地（含梯田）位于25度以上陡坡。

从人均耕地看，2009年，全省人均耕地较1996年一次调查时的0.159公顷（2.38亩）有所下降，略高于全国人均耕地0.101公顷（1.52亩），但仍明显低于世界人均耕地0.225公顷（3.38亩）水平。

云南省第二次全国土地调查自2007年7月1日起开展，以2009年12月31为标准时点汇总二次数据调查，全面查清了全省土地利用现状，掌握了我省各类土地资源家底。

《关于云南省第二次全国土地调查主要数据成果的公报》指出，综合考虑全省现有耕地数量、质量和人口增长、发展用地需求等因素，我省耕地保护形势仍十分严峻。人均耕地少、耕地质量总体不高、耕地后备资源不足的基本省情没有改变。同时，建设用地增加虽与经济社会发展要求相适应，但部分地方建设用地格局失衡、利用粗放、效率不高，建设用地供需矛盾仍突出。因此，必须毫不动摇坚持最严格的耕地保护制度和节约用地制度，在严格控制增量土地的同时，进一步加大盘活存量土地的力度，大力推进生态文明建设。